1. Melalui Teller (BSI/BRI)
   1. Datang ke bank, informasikan kepada teller Nama Institusi dan Kode Bayar. Contoh 260xxxxxxxx. Untuk bank selain BSI/BRI harus menyertakan kode bank:
      • Kode BSI (9002310) + Kode Bayar, misal 9002310260xxxxxxxx
      • Kode BRI (15003) + Kode Bayar, misal 15003260xxxxxxxx
   2. Teller akan memproses inquiry tagihan melalui aplikasi pembayaran institusi
   3. Sesuai dengan jumlah tagihan, pemustaka menyerahkan fisik uang kepada Teller
   4. Pemustaka akan mendapatkan tanda bukti transaksi dari Teller
2. Melalui Mesin ATM (BSI/BRI)
   1. Datang ke ATM
   2. Masukkan kartu dan PIN
   3. Pilih menu Transfer atau Transaksi Lain > Pembayaran > Pendidikan
   4. Pilih Bank Tujuan
   5. Masukkan Kode Bayar
      • Kode BSI (9002310) + Kode Bayar, misal 9002310260xxxxxxxx
      • Kode BRI (15003) + Kode Bayar, misal 15003260xxxxxxxx
   6. Masukkan nominal pembayaran
   7. Konfirmasi
   8. Selesai
3. Melalui Aplikasi Mobile (Byond/BRImo)
   1. Byond (BSI)
      • Masuk Aplikasi
      • Pilih menu Bayar & Beli
      • Pilih Akademik
      • Cari dan Pilih UIN Madura
      • Masukkan Kode Bayar
      • Konfirmasi
      • Selesai
   2. BRImo (BRI)
      • Masuk Aplikasi
      • Pilih menu BRIVA
        • Tambah Transaksi Baru
        • Masukkan 15003 + Kode Bayar, contoh (15003260xxxxxxxx)
        • Konfirmasi
        • Selesai
      • Pilih menu Tagihan
        • Pilih menu Pendidikan
        • Cari dan Pilih UIN Madura
        • Masukkan Kode Bayar
        • Konfirmasi
        • Selesai
4. Melalui Bank Lain termasuk Bank Digital (selain BSI dan BRI) atau e-Wallet (Dana, GoPay, OVO, LinkAja, ShopeePay, dll.)
   1. Masuk Aplikasi
   2. Pilih Transfer atau Kirim
   3. Pilih Bank Tujuan
      • Untuk BSI, masukkan Kode BSI (9002310) + Kode Bayar, misal 9002310260xxxxxxxx
      • Untuk BRI, masukkan Kode BRI (15003) + Kode Bayar, misal 15003260xxxxxxxx 
   4. Masukkan nominal
   5. Konfirmasi
   6. Selesai

Disarankan memakai GoPay untuk membayar tanpa biaya admin. Langkah-langkahnya adalah sebagai berikut: